个人所得税经营所得网上申报目前可以通过自然人电子税务局扣缴端和WEB端扣缴功能进行代理申报，也可以由投资人或业主自己在自然人电子税务局WEB端自行申报。
　　【自然人电子税务局扣缴端】代理申报：办税人员登录扣缴端后，点击顶部“经营所得”按钮进入申报模块进行经营所得月（季）度申报、缴款等操作。
　　【自然人电子税务局WEB端扣缴功能】代理申报：办税人员可以登录自然电子税务局WEB端，点击“单位办税”,选择对应的单位，点击“经营所得”进入申报模块进行经营所得月（季）度申报、缴款等操作。
　　【自然人电子税务局WEB端】业主或投资人可以通过自然人电子税务局WEB端进行申报。首次登录需要通过实名认证，登录成功后，点击顶部“申报管理”按钮进入申报界面，可申报“经营所得个人所得税月（季）度申报（A表）”、“经营所得个人所得税年度申报（B表）”、多处经营所得个人所得税汇总年度申报（C表）。